Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcnt1Q09324 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcnt1Q09324 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms