Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
1700061G19RikQ08EE8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700061G19RikQ08EE8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms