Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SctQ08535 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SctQ08535 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SctQ08535 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SctQ08535 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SctQ08535 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SctQ08535 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SctQ08535 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SctQ08535 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SctQ08535 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SctQ08535 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SctQ08535 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SctQ08535 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SctQ08535 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SctQ08535 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SctQ08535 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SctQ08535 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SctQ08535 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SctQ08535 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SctQ08535 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SctQ08535 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SctQ08535 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SctQ08535 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SctQ08535 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SctQ08535 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SctQ08535 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SctQ08535 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SctQ08535 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SctQ08535 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SctQ08535 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SctQ08535 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SctQ08535 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SctQ08535 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SctQ08535 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SctQ08535 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SctQ08535 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SctQ08535 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SctQ08535 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SctQ08535 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SctQ08535 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SctQ08535 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SctQ08535 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SctQ08535 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SctQ08535 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SctQ08535 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SctQ08535 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SctQ08535 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SctQ08535 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SctQ08535 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SctQ08535 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SctQ08535 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SctQ08535 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SctQ08535 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SctQ08535 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SctQ08535 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SctQ08535 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SctQ08535 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SctQ08535 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SctQ08535 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SctQ08535 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SctQ08535 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SctQ08535 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SctQ08535 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SctQ08535 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SctQ08535 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SctQ08535 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SctQ08535 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SctQ08535 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SctQ08535 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SctQ08535 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SctQ08535 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SctQ08535 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SctQ08535 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SctQ08535 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SctQ08535 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SctQ08535 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SctQ08535 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SctQ08535 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms