Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Calb2Q08331 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb2Q08331 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms