Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tgm3Q08189 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgm3Q08189 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms