Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a2Q07643 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a2Q07643 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms