Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Col17a1Q07563 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Col17a1Q07563 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col17a1Q07563 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms