Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cntn3Q07409 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cntn3Q07409 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms