Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Siah1bQ06985 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Siah1bQ06985 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Siah1bQ06985 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms