Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox4Q06831 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sox4Q06831 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox4Q06831 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms