Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Caprin2Q05A80 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Caprin2Q05A80 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms