Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnal1Q05A62 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms