Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnd1Q03719 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kcnd1Q03719 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms