Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs2Q03350 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Thbs2Q03350 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms