Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddr1Q03146 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ddr1Q03146 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms