Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Epha4Q03137 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms