Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mmp11Q02853 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mmp11Q02853 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms