Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col6a2Q02788 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Col6a2Q02788 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms