Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlh1Q02576 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlh1Q02576 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlh1Q02576 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nhlh1Q02576 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlh1Q02576 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlh1Q02576 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlh1Q02576 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlh1Q02576 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlh1Q02576 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlh1Q02576 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlh1Q02576 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlh1Q02576 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlh1Q02576 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlh1Q02576 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlh1Q02576 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlh1Q02576 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlh1Q02576 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlh1Q02576 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nhlh1Q02576 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlh1Q02576 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlh1Q02576 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms