Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdcd1Q02242 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms