Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snai1Q02085 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snai1Q02085 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms