Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Mc1rQ01727 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms