Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja5Q01231 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja5Q01231 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms