Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2cQ01098 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grin2cQ01098 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms