Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pde1bQ01065 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms