Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rbp4Q00724 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbp4Q00724 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms