Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PgrQ00175 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PgrQ00175 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PgrQ00175 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PgrQ00175 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PgrQ00175 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PgrQ00175 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PgrQ00175 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PgrQ00175 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PgrQ00175 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PgrQ00175 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PgrQ00175 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PgrQ00175 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms