Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas1P97459 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas1P97459 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas1P97459 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas1P97459 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas1P97459 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas1P97459 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas1P97459 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas1P97459 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas1P97459 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Npas1P97459 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms