Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crmp1P97427 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Crmp1P97427 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms