Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms