Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx3P81067 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irx3P81067 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irx3P81067 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx3P81067 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx3P81067 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx3P81067 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx3P81067 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx3P81067 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx3P81067 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx3P81067 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx3P81067 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms