Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx2P81066 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx2P81066 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx2P81066 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms