Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx2P80206 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx2P80206 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx2P80206 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otx2P80206 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms