Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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