Protein–RNA interactions for Protein: P70387

Hfe, Hereditary hemochromatosis protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HfeP70387 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HfeP70387 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HfeP70387 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HfeP70387 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HfeP70387 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HfeP70387 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HfeP70387 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HfeP70387 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HfeP70387 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HfeP70387 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HfeP70387 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HfeP70387 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HfeP70387 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HfeP70387 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HfeP70387 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HfeP70387 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HfeP70387 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HfeP70387 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HfeP70387 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HfeP70387 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HfeP70387 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HfeP70387 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HfeP70387 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HfeP70387 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HfeP70387 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HfeP70387 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HfeP70387 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HfeP70387 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HfeP70387 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HfeP70387 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HfeP70387 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HfeP70387 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HfeP70387 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HfeP70387 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HfeP70387 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HfeP70387 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HfeP70387 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HfeP70387 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HfeP70387 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HfeP70387 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HfeP70387 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HfeP70387 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HfeP70387 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HfeP70387 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HfeP70387 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HfeP70387 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HfeP70387 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HfeP70387 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HfeP70387 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HfeP70387 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HfeP70387 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HfeP70387 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HfeP70387 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HfeP70387 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HfeP70387 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HfeP70387 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HfeP70387 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HfeP70387 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HfeP70387 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HfeP70387 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HfeP70387 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HfeP70387 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HfeP70387 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HfeP70387 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HfeP70387 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HfeP70387 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HfeP70387 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HfeP70387 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HfeP70387 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HfeP70387 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HfeP70387 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HfeP70387 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HfeP70387 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HfeP70387 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HfeP70387 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HfeP70387 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HfeP70387 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HfeP70387 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HfeP70387 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HfeP70387 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HfeP70387 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HfeP70387 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HfeP70387 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HfeP70387 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HfeP70387 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HfeP70387 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HfeP70387 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HfeP70387 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HfeP70387 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HfeP70387 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HfeP70387 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HfeP70387 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HfeP70387 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HfeP70387 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HfeP70387 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HfeP70387 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HfeP70387 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HfeP70387 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HfeP70387 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HfeP70387 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms