Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pitx1P70314 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pitx1P70314 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pitx1P70314 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pitx1P70314 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pitx1P70314 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pitx1P70314 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pitx1P70314 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pitx1P70314 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pitx1P70314 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pitx1P70314 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pitx1P70314 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pitx1P70314 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pitx1P70314 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pitx1P70314 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pitx1P70314 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pitx1P70314 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pitx1P70314 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pitx1P70314 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pitx1P70314 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms