Protein–RNA interactions for Protein: P70195

Psmb7, Proteasome subunit beta type-7, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb7P70195 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb7P70195 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb7P70195 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms