Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp2P63044 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms