Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrx1P63013 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms