Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gnb1P62874 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms