Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2481.5 ms