Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11aP62492 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms