Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf6P62331 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf6P62331 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf6P62331 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf6P62331 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arf6P62331 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arf6P62331 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms