Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm5P62322 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm5P62322 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms