Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps29P62274 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps29P62274 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps29P62274 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rps29P62274 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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