Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan5P62080 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan5P62080 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan5P62080 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan5P62080 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan5P62080 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tspan5P62080 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan5P62080 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms