Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga11P61622 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga11P61622 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga11P61622 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga11P61622 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga11P61622 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga11P61622 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga11P61622 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga11P61622 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga11P61622 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms