Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf13P61216 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf13P61216 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf13P61216 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms