Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Siah1aP61092 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Siah1aP61092 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms