Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2kP61087 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2kP61087 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms